TeXの文書を書くとき，いつも書く命令があります．パッケージを読み込んだり，余白を調節したり，マクロを定義したり．ここではいつも自分が使う命令を書いたテンプレートをリストアップしておきます．
やっているのは主に上下余白の調整です（どうも標準だと余白が大きすぎると感じるので）．
ここでは \documentclass{} に jsarticle や jsbook を指定しています．これは奥村さんの提唱するpLaTeX2eの新ドキュメントクラスです．デフォルトの jarticle などより優れた点が多いので僕はいつもこれを利用しています．入手方法などについては配布元である 奥村さんの解説ページ を参考にするのが一番でしょう．
以下，...と表記しているのはそこに本文などを書く，ということです． %からはじまる行はコメントです．また，ページ余白などを\setlengthで調整しているので，文字サイズを変更すると本文がページからはみ出たりします．その場合は\setlengthの行を調整するか削除するかコメントアウトしてください．調整する場合，基本的には
\setlength{\textheight}{40\baselineskip}
などの部分の数字（ここでは40）を変更するだけでいいと思います．また，ベクトル解析記号の div，grad，rot はよく使うのでマクロで定義しています．
デフォルトで入っているmyheadingsスタイルを使い，柱の内容を設定します．柱は\markright{}に書いたものが出力されます．
\documentclass[11pt,a4paper]{jsarticle}
%
\usepackage{amsmath,amssymb}
\usepackage{bm}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{ascmac}
%
\setlength{\textwidth}{\fullwidth}
\setlength{\textheight}{39\baselineskip}
\addtolength{\textheight}{\topskip}
\setlength{\voffset}{-0.5in}
\setlength{\headsep}{0.3in}
%
\newcommand{\divergence}{\mathrm{div}\,} %ダイバージェンス
\newcommand{\grad}{\mathrm{grad}\,} %グラディエント
\newcommand{\rot}{\mathrm{rot}\,} %ローテーション
%
\pagestyle{myheadings}
\markright{\footnotesize \sf 物理のかぎしっぽ \ \texttt{ http://www12.plala.or.jp/ksp/}}
\begin{document}
%
%
\section*{◆タイトル◆}
...
...
%
%
\end{document}
出力は，たとえばつぎのようになります．
最初のページ先頭にタイトル，名前，日付を出力する標準的なものです．学校のレポートはこの形で提出しています．
\documentclass[11pt,a4paper]{jsarticle}
%
\usepackage{amsmath,amssymb}
\usepackage{bm}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{ascmac}
%
\setlength{\textwidth}{\fullwidth}
\setlength{\textheight}{40\baselineskip}
\addtolength{\textheight}{\topskip}
\setlength{\voffset}{-0.2in}
\setlength{\topmargin}{0pt}
\setlength{\headheight}{0pt}
\setlength{\headsep}{0pt}
%
\newcommand{\divergence}{\mathrm{div}\,} %ダイバージェンス
\newcommand{\grad}{\mathrm{grad}\,} %グラディエント
\newcommand{\rot}{\mathrm{rot}\,} %ローテーション
%
\title{...}
\author{...}
\date{\today}
\begin{document}
\maketitle
%
%
\section{...}
...
...
%
%
\end{document}
出力は，たとえばつぎのようになります．
卒論などの長い文章のとき用です．長くなると1つのファイルにすべての文章を書くのは大変なので，ファイルを分割して\include{}で取り込みます．
\documentclass[a4paper,11pt,oneside,openany]{jsbook}
%
\usepackage{amsmath,amssymb}
\usepackage{bm}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{subfigure}
\usepackage{verbatim}
\usepackage{wrapfig}
\usepackage{ascmac}
\usepackage{makeidx}
%
\makeindex
%
\setlength{\textwidth}{\fullwidth}
\setlength{\textheight}{40\baselineskip}
\addtolength{\textheight}{\topskip}
\setlength{\voffset}{-0.55in}
%
\newcommand{\diff}{\mathrm{d}} %微分記号
\newcommand{\divergence}{\mathrm{div}\,} %ダイバージェンス
\newcommand{\grad}{\mathrm{grad}\,} %グラディエント
\newcommand{\rot}{\mathrm{rot}\,} %ローテーション
%
\title{...}
\author{...}
\date{\today}
\begin{document}
%
%
\maketitle
%
%
\frontmatter
%
\addcontentsline{toc}{chapter}{概要}
\include{abstract}
\tableofcontents
%
%
\mainmatter
%
\include{chap1}
\include{chap2}
\include{chap3}
\include{chap4}
%
%
\appendix
%
\include{appendixA}
\include{appendixB}
%
%
\chapter*{謝辞}
\addcontentsline{toc}{chapter}{謝辞}
...
...
%
%
\include{biblography}
%
%
\newpage
\printindex
%
%
\end{document}
\include{}に指定したファイルは，拡張子.texが補完されて読み込まれます．つまり上のように書いた場合は，同じディレクトリに abstract.tex，chap1.tex，chap2.tex， chap3.tex，chap4.tex，appendixA.tex，appendixB.tex，biblography.tex というファイルをつくっておき，そのファイルに内容を書き込みます．
このサイトの物理ハンドブック，物理数学ハンドブックはこの設定でつくっています．
\documentclass[a4j,10pt,oneside,openany]{jsbook}
%
\usepackage{amsmath,amssymb}
\usepackage{bm}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{ascmac}
\usepackage{makeidx}
%
\makeindex
%
\newcommand{\diff}{\mathrm{d}} %微分記号
\newcommand{\divergence}{\mathrm{div}\,} %ダイバージェンス
\newcommand{\grad}{\mathrm{grad}\,} %グラディエント
\newcommand{\rot}{\mathrm{rot}\,} %ローテーション
%
\setlength{\textwidth}{\fullwidth}
\setlength{\textheight}{44\baselineskip}
\addtolength{\textheight}{\topskip}
\setlength{\voffset}{-0.6in}
%
\title{{\Huge \textbf{物理学ハンドブック}}\\ {\small Ver. 0.17.0}}
\author{物理のかぎしっぽ\\ \texttt{http://www12.plala.or.jp/ksp/}}
\date{\today}
\begin{document}
%
%
\maketitle
\frontmatter
\tableofcontents
%
%
\mainmatter
\chapter{...}
\begin{abstract}
...
...
\end{abstract}
\section{...}
...
...
\begin{thebibliography}{20}
\bibitem{...}...
...
\end{thebibliography}
\newpage
\printindex
%
%
\end{document}
出力は，たとえばつぎのようになります．
